Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt4B2RU40 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt4B2RU40 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms