Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Znf518bB2RRE4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms