Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Brpf3B2KF05 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brpf3B2KF05 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms