Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CK137956B1AYM9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CK137956B1AYM9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms