Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mbd5B1AYB6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Mbd5B1AYB6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Mbd5B1AYB6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms