Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ube2uB1AUC4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ube2uB1AUC4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms