Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Skint7A7XV04 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Skint7A7XV04 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Skint7A7XV04 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Skint7A7XV04 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms