Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc9bA3KGF9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc9bA3KGF9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms