Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r232A2RTT5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r232A2RTT5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms