Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2al1jA2BFR3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2al1jA2BFR3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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