Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upf2A2AT37 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Upf2A2AT37 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms