Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lgr4A2ARI4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lgr4A2ARI4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms