Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rtf1A2AQ19 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtf1A2AQ19 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtf1A2AQ19 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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