Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CtcflA2APF3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtcflA2APF3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms