Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zkscan16A2ALW2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zkscan16A2ALW2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms