Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FocadA2AKG8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FocadA2AKG8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FocadA2AKG8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms