Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin3aA2AIR5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin3aA2AIR5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms