Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ambra1A2AH22 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ambra1A2AH22 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms