Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube2dnl2A2AFH2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2dnl2A2AFH2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms