Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cyb561d1A2AE42 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms