Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pkd2l1A2A259 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkd2l1A2A259 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms