Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nlrp1bA1Z198 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nlrp1bA1Z198 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms