Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc173A0JLY1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc173A0JLY1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms