Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd3A0A140LIW3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms