Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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Trbv21A0A0A6YX06 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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Trbv21A0A0A6YX06 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Trbv21A0A0A6YX06 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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Trbv21A0A0A6YX06 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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Trbv21A0A0A6YX06 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trbv21A0A0A6YX06 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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Trbv21A0A0A6YX06 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Trbv21A0A0A6YX06 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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Trbv21A0A0A6YX06 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Trbv21A0A0A6YX06 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Trbv21A0A0A6YX06 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Trbv21A0A0A6YX06 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trbv21A0A0A6YX06 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Trbv21A0A0A6YX06 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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