Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrit3W8DXL4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrit3W8DXL4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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