Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csmd2V9GX34 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csmd2V9GX34 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms