Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vstm4T1NXB5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vstm4T1NXB5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms