Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt85Q9Z2T6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt85Q9Z2T6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt85Q9Z2T6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt85Q9Z2T6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt85Q9Z2T6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt85Q9Z2T6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt85Q9Z2T6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt85Q9Z2T6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt85Q9Z2T6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt85Q9Z2T6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt85Q9Z2T6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt85Q9Z2T6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt85Q9Z2T6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt85Q9Z2T6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt85Q9Z2T6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt85Q9Z2T6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt85Q9Z2T6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms