Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd3Q9Z2D8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd3Q9Z2D8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd3Q9Z2D8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms