Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mbd4Q9Z2D7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mbd4Q9Z2D7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms