Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rlbp1Q9Z275 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rlbp1Q9Z275 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rlbp1Q9Z275 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms