Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tulp1Q9Z273 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tulp1Q9Z273 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tulp1Q9Z273 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms