Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ap3b1Q9Z1T1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms