Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D17h6s53eQ9Z1R4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms