Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hmg20bQ9Z104 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hmg20bQ9Z104 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms