Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV03

Fam50a, Protein FAM50A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50aQ9WV03 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fam50aQ9WV03 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam50aQ9WV03 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms