Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnip1Q9WUU8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnip1Q9WUU8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms