Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdcd6ipQ9WU78 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd6ipQ9WU78 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd6ipQ9WU78 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms