Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nrf1Q9WU00 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrf1Q9WU00 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms