Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfe2l3Q9WTM4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nfe2l3Q9WTM4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms