Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam50bQ9WTJ8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam50bQ9WTJ8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms