Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PplQ9R269 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PplQ9R269 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PplQ9R269 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PplQ9R269 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PplQ9R269 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PplQ9R269 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PplQ9R269 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PplQ9R269 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PplQ9R269 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PplQ9R269 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PplQ9R269 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PplQ9R269 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PplQ9R269 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PplQ9R269 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PplQ9R269 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms