Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Abcc6Q9R1S7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Abcc6Q9R1S7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcc6Q9R1S7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms