Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vav3Q9R0C8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Vav3Q9R0C8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms