Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Npas3Q9QZQ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Npas3Q9QZQ0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms