Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ChmlQ9QZD5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ChmlQ9QZD5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms