Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx8Q9QXV1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx8Q9QXV1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cbx8Q9QXV1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms