Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Limd1Q9QXD8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Limd1Q9QXD8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Limd1Q9QXD8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms