Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc5Q9QX29 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc5Q9QX29 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc5Q9QX29 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms